Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GLI3P10071 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GLI3P10071 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GLI3P10071 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GLI3P10071 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GLI3P10071 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GLI3P10071 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GLI3P10071 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GLI3P10071 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GLI3P10071 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GLI3P10071 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GLI3P10071 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GLI3P10071 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GLI3P10071 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GLI3P10071 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GLI3P10071 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GLI3P10071 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GLI3P10071 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GLI3P10071 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GLI3P10071 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GLI3P10071 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GLI3P10071 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GLI3P10071 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GLI3P10071 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GLI3P10071 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GLI3P10071 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GLI3P10071 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GLI3P10071 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GLI3P10071 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GLI3P10071 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GLI3P10071 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GLI3P10071 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GLI3P10071 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GLI3P10071 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GLI3P10071 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GLI3P10071 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GLI3P10071 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GLI3P10071 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GLI3P10071 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GLI3P10071 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GLI3P10071 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GLI3P10071 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GLI3P10071 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GLI3P10071 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GLI3P10071 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GLI3P10071 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GLI3P10071 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GLI3P10071 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GLI3P10071 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GLI3P10071 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GLI3P10071 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GLI3P10071 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GLI3P10071 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GLI3P10071 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GLI3P10071 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GLI3P10071 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GLI3P10071 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GLI3P10071 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GLI3P10071 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GLI3P10071 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GLI3P10071 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GLI3P10071 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GLI3P10071 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GLI3P10071 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GLI3P10071 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GLI3P10071 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GLI3P10071 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GLI3P10071 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GLI3P10071 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GLI3P10071 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GLI3P10071 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GLI3P10071 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GLI3P10071 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GLI3P10071 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GLI3P10071 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GLI3P10071 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GLI3P10071 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GLI3P10071 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GLI3P10071 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GLI3P10071 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GLI3P10071 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GLI3P10071 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GLI3P10071 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GLI3P10071 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GLI3P10071 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GLI3P10071 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GLI3P10071 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GLI3P10071 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GLI3P10071 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GLI3P10071 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GLI3P10071 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GLI3P10071 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GLI3P10071 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GLI3P10071 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GLI3P10071 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GLI3P10071 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GLI3P10071 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GLI3P10071 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GLI3P10071 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GLI3P10071 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms