Protein–RNA interactions for Protein: P02730

SLC4A1, Band 3 anion transport protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A1P02730 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC4A1P02730 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC4A1P02730 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC4A1P02730 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC4A1P02730 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC4A1P02730 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC4A1P02730 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC4A1P02730 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC4A1P02730 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC4A1P02730 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC4A1P02730 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC4A1P02730 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC4A1P02730 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC4A1P02730 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC4A1P02730 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC4A1P02730 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC4A1P02730 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC4A1P02730 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC4A1P02730 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC4A1P02730 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC4A1P02730 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC4A1P02730 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC4A1P02730 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC4A1P02730 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC4A1P02730 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC4A1P02730 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC4A1P02730 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC4A1P02730 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC4A1P02730 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC4A1P02730 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC4A1P02730 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC4A1P02730 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC4A1P02730 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC4A1P02730 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC4A1P02730 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC4A1P02730 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC4A1P02730 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC4A1P02730 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC4A1P02730 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC4A1P02730 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC4A1P02730 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC4A1P02730 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC4A1P02730 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC4A1P02730 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC4A1P02730 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC4A1P02730 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC4A1P02730 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC4A1P02730 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC4A1P02730 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC4A1P02730 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC4A1P02730 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC4A1P02730 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC4A1P02730 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC4A1P02730 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC4A1P02730 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC4A1P02730 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC4A1P02730 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC4A1P02730 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC4A1P02730 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC4A1P02730 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC4A1P02730 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC4A1P02730 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC4A1P02730 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC4A1P02730 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC4A1P02730 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC4A1P02730 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC4A1P02730 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC4A1P02730 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC4A1P02730 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC4A1P02730 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC4A1P02730 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC4A1P02730 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC4A1P02730 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC4A1P02730 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC4A1P02730 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC4A1P02730 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC4A1P02730 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC4A1P02730 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC4A1P02730 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC4A1P02730 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC4A1P02730 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC4A1P02730 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC4A1P02730 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC4A1P02730 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC4A1P02730 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC4A1P02730 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC4A1P02730 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC4A1P02730 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC4A1P02730 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC4A1P02730 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC4A1P02730 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC4A1P02730 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC4A1P02730 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC4A1P02730 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC4A1P02730 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC4A1P02730 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC4A1P02730 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC4A1P02730 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC4A1P02730 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC4A1P02730 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms