Protein–RNA interactions for Protein: P01891

HLA-A, HLA class I histocompatibility antigen, A-68 alpha chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-AP01891 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-AP01891 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HLA-AP01891 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-AP01891 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-AP01891 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-AP01891 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-AP01891 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-AP01891 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-AP01891 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-AP01891 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-AP01891 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-AP01891 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-AP01891 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-AP01891 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-AP01891 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-AP01891 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HLA-AP01891 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-AP01891 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-AP01891 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-AP01891 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-AP01891 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-AP01891 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-AP01891 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-AP01891 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-AP01891 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-AP01891 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-AP01891 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-AP01891 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-AP01891 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-AP01891 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-AP01891 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-AP01891 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-AP01891 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-AP01891 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-AP01891 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-AP01891 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-AP01891 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-AP01891 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-AP01891 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-AP01891 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-AP01891 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-AP01891 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HLA-AP01891 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-AP01891 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-AP01891 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-AP01891 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-AP01891 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-AP01891 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-AP01891 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-AP01891 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-AP01891 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-AP01891 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-AP01891 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-AP01891 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-AP01891 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-AP01891 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-AP01891 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-AP01891 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-AP01891 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-AP01891 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-AP01891 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HLA-AP01891 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-AP01891 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-AP01891 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-AP01891 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-AP01891 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-AP01891 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-AP01891 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-AP01891 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-AP01891 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-AP01891 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HLA-AP01891 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-AP01891 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-AP01891 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-AP01891 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-AP01891 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-AP01891 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-AP01891 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-AP01891 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HLA-AP01891 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-AP01891 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-AP01891 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-AP01891 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-AP01891 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-AP01891 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-AP01891 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-AP01891 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-AP01891 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-AP01891 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-AP01891 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-AP01891 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-AP01891 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-AP01891 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HLA-AP01891 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HLA-AP01891 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.05■□□□□ 0
HLA-AP01891 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HLA-AP01891 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HLA-AP01891 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HLA-AP01891 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HLA-AP01891 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms