Protein–RNA interactions for Protein: O95819

MAP4K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP4K4O95819 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MAP4K4O95819 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms