Protein–RNA interactions for Protein: O43526

KCNQ2, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 2, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ2O43526 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNQ2O43526 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms