Protein–RNA interactions for Protein: O43524

FOXO3, Forkhead box protein O3, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO3O43524 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXO3O43524 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXO3O43524 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXO3O43524 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXO3O43524 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXO3O43524 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXO3O43524 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXO3O43524 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXO3O43524 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXO3O43524 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXO3O43524 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXO3O43524 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXO3O43524 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXO3O43524 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXO3O43524 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXO3O43524 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXO3O43524 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXO3O43524 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXO3O43524 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXO3O43524 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXO3O43524 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXO3O43524 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXO3O43524 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXO3O43524 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FOXO3O43524 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms