Protein–RNA interactions for Protein: O43255

SIAH2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH2O43255 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms