Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASKO14936 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASKO14936 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASKO14936 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASKO14936 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASKO14936 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASKO14936 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASKO14936 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASKO14936 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CASKO14936 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASKO14936 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASKO14936 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASKO14936 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASKO14936 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CASKO14936 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASKO14936 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CASKO14936 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASKO14936 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASKO14936 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASKO14936 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASKO14936 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASKO14936 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASKO14936 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASKO14936 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASKO14936 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASKO14936 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASKO14936 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASKO14936 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASKO14936 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASKO14936 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASKO14936 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASKO14936 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASKO14936 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASKO14936 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASKO14936 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASKO14936 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASKO14936 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASKO14936 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASKO14936 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASKO14936 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASKO14936 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASKO14936 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASKO14936 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASKO14936 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CASKO14936 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASKO14936 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASKO14936 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASKO14936 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASKO14936 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASKO14936 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASKO14936 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASKO14936 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASKO14936 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASKO14936 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASKO14936 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASKO14936 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASKO14936 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASKO14936 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASKO14936 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASKO14936 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASKO14936 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASKO14936 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CASKO14936 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CASKO14936 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASKO14936 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASKO14936 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASKO14936 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASKO14936 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASKO14936 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASKO14936 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASKO14936 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASKO14936 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASKO14936 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CASKO14936 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASKO14936 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASKO14936 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASKO14936 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASKO14936 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASKO14936 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASKO14936 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASKO14936 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASKO14936 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASKO14936 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CASKO14936 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASKO14936 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CASKO14936 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASKO14936 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASKO14936 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASKO14936 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASKO14936 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASKO14936 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASKO14936 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASKO14936 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASKO14936 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CASKO14936 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASKO14936 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASKO14936 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASKO14936 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASKO14936 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASKO14936 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms