Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRTO14522 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRTO14522 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
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