Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF316A6NFI3 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF316A6NFI3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF316A6NFI3 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF316A6NFI3 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF316A6NFI3 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF316A6NFI3 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF316A6NFI3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF316A6NFI3 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF316A6NFI3 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF316A6NFI3 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF316A6NFI3 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF316A6NFI3 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF316A6NFI3 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF316A6NFI3 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF316A6NFI3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF316A6NFI3 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF316A6NFI3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF316A6NFI3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF316A6NFI3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF316A6NFI3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF316A6NFI3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF316A6NFI3 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF316A6NFI3 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF316A6NFI3 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF316A6NFI3 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF316A6NFI3 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF316A6NFI3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF316A6NFI3 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF316A6NFI3 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF316A6NFI3 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF316A6NFI3 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF316A6NFI3 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF316A6NFI3 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF316A6NFI3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF316A6NFI3 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF316A6NFI3 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF316A6NFI3 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF316A6NFI3 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF316A6NFI3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF316A6NFI3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF316A6NFI3 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF316A6NFI3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF316A6NFI3 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF316A6NFI3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF316A6NFI3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF316A6NFI3 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF316A6NFI3 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF316A6NFI3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF316A6NFI3 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF316A6NFI3 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF316A6NFI3 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF316A6NFI3 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF316A6NFI3 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF316A6NFI3 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF316A6NFI3 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF316A6NFI3 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF316A6NFI3 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF316A6NFI3 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF316A6NFI3 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF316A6NFI3 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF316A6NFI3 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF316A6NFI3 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF316A6NFI3 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF316A6NFI3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF316A6NFI3 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF316A6NFI3 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF316A6NFI3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF316A6NFI3 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF316A6NFI3 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF316A6NFI3 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF316A6NFI3 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF316A6NFI3 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF316A6NFI3 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF316A6NFI3 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF316A6NFI3 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF316A6NFI3 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms