Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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