Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X0

SNX10, Sorting nexin-10, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX10Q9Y5X0 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX10Q9Y5X0 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms