Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms