Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms