Protein–RNA interactions for Protein: Q9XRX5

HHLA3, HERV-H LTR-associating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA3Q9XRX5 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms