Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV1

FZD4, Frizzled-4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD4Q9ULV1 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms