Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM5BQ9UGL1 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC27.57■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC27.57■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.57■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC27.57■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC27.57■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC27.55■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC27.54■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC27.53■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms