Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
DKK3Q9UBP4 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms