Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TFIP11Q9UBB9 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms