Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms