Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ATAD3AQ9NVI7 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms