Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms