Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms