Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
LTBP3Q9NS15 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms