Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ76

MEPE, Matrix extracellular phosphoglycoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEPEQ9NQ76 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms