Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms