Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms