Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms