Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms