Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms