Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY5

CAPS2, Calcyphosin-2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPS2Q9BXY5 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPS2Q9BXY5 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPS2Q9BXY5 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPS2Q9BXY5 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPS2Q9BXY5 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPS2Q9BXY5 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPS2Q9BXY5 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPS2Q9BXY5 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPS2Q9BXY5 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPS2Q9BXY5 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPS2Q9BXY5 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPS2Q9BXY5 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPS2Q9BXY5 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPS2Q9BXY5 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPS2Q9BXY5 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPS2Q9BXY5 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPS2Q9BXY5 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPS2Q9BXY5 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPS2Q9BXY5 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPS2Q9BXY5 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPS2Q9BXY5 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPS2Q9BXY5 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPS2Q9BXY5 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPS2Q9BXY5 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPS2Q9BXY5 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPS2Q9BXY5 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPS2Q9BXY5 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPS2Q9BXY5 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPS2Q9BXY5 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPS2Q9BXY5 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPS2Q9BXY5 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPS2Q9BXY5 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPS2Q9BXY5 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPS2Q9BXY5 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPS2Q9BXY5 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPS2Q9BXY5 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPS2Q9BXY5 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPS2Q9BXY5 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPS2Q9BXY5 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPS2Q9BXY5 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPS2Q9BXY5 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPS2Q9BXY5 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPS2Q9BXY5 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPS2Q9BXY5 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPS2Q9BXY5 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPS2Q9BXY5 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPS2Q9BXY5 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPS2Q9BXY5 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPS2Q9BXY5 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPS2Q9BXY5 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPS2Q9BXY5 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPS2Q9BXY5 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPS2Q9BXY5 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPS2Q9BXY5 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPS2Q9BXY5 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPS2Q9BXY5 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPS2Q9BXY5 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPS2Q9BXY5 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPS2Q9BXY5 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPS2Q9BXY5 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPS2Q9BXY5 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPS2Q9BXY5 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPS2Q9BXY5 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPS2Q9BXY5 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPS2Q9BXY5 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPS2Q9BXY5 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPS2Q9BXY5 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPS2Q9BXY5 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPS2Q9BXY5 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPS2Q9BXY5 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPS2Q9BXY5 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPS2Q9BXY5 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPS2Q9BXY5 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPS2Q9BXY5 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPS2Q9BXY5 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPS2Q9BXY5 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPS2Q9BXY5 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPS2Q9BXY5 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPS2Q9BXY5 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPS2Q9BXY5 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPS2Q9BXY5 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPS2Q9BXY5 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPS2Q9BXY5 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPS2Q9BXY5 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPS2Q9BXY5 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPS2Q9BXY5 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPS2Q9BXY5 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPS2Q9BXY5 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPS2Q9BXY5 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPS2Q9BXY5 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPS2Q9BXY5 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPS2Q9BXY5 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPS2Q9BXY5 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPS2Q9BXY5 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPS2Q9BXY5 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPS2Q9BXY5 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPS2Q9BXY5 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPS2Q9BXY5 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPS2Q9BXY5 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPS2Q9BXY5 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms