Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms