Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWE0

REPIN1, Replication initiator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPIN1Q9BWE0 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 MALAT1-217ENST00000620902 352 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 RPS14P4-201ENST00000415880 418 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 AC020892.1-201ENST00000559918 855 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms