Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms