Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP7

MGME1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGME1Q9BQP7 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MGME1Q9BQP7 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms