Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms