Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MEIS3Q99687 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms