Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

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Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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