Protein–RNA interactions for Protein: Q96P69

GPR78, G-protein coupled receptor 78, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR78Q96P69 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms