Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EP400Q96L91 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms