Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms