Protein–RNA interactions for Protein: Q96AG4

LRRC59, Leucine-rich repeat-containing protein 59, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC59Q96AG4 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC59Q96AG4 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC59Q96AG4 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC59Q96AG4 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC59Q96AG4 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC59Q96AG4 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC59Q96AG4 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC59Q96AG4 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC59Q96AG4 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC59Q96AG4 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC59Q96AG4 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC59Q96AG4 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC59Q96AG4 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC59Q96AG4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC59Q96AG4 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC59Q96AG4 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC59Q96AG4 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC59Q96AG4 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC59Q96AG4 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC59Q96AG4 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC59Q96AG4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC59Q96AG4 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC59Q96AG4 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC59Q96AG4 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC59Q96AG4 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC59Q96AG4 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC59Q96AG4 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC59Q96AG4 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC59Q96AG4 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC59Q96AG4 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC59Q96AG4 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC59Q96AG4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC59Q96AG4 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC59Q96AG4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC59Q96AG4 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC59Q96AG4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC59Q96AG4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC59Q96AG4 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC59Q96AG4 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC59Q96AG4 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC59Q96AG4 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC59Q96AG4 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC59Q96AG4 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC59Q96AG4 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC59Q96AG4 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC59Q96AG4 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC59Q96AG4 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC59Q96AG4 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC59Q96AG4 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC59Q96AG4 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC59Q96AG4 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC59Q96AG4 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC59Q96AG4 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC59Q96AG4 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC59Q96AG4 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC59Q96AG4 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC59Q96AG4 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC59Q96AG4 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC59Q96AG4 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC59Q96AG4 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms