Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms