Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms