Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATRIPQ8WXE1 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms