Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms