Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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