Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC112Q8NEF3 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC112Q8NEF3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC112Q8NEF3 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC112Q8NEF3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC112Q8NEF3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC112Q8NEF3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC112Q8NEF3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC112Q8NEF3 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC112Q8NEF3 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC112Q8NEF3 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC112Q8NEF3 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC112Q8NEF3 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC112Q8NEF3 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC112Q8NEF3 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC112Q8NEF3 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms