Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms