Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
DNAAF3Q8N9W5 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
DNAAF3Q8N9W5 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
DNAAF3Q8N9W5 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAAF3Q8N9W5 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAAF3Q8N9W5 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAAF3Q8N9W5 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAAF3Q8N9W5 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAAF3Q8N9W5 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAAF3Q8N9W5 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAAF3Q8N9W5 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAAF3Q8N9W5 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAAF3Q8N9W5 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAAF3Q8N9W5 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAAF3Q8N9W5 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAAF3Q8N9W5 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAAF3Q8N9W5 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAAF3Q8N9W5 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAAF3Q8N9W5 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAAF3Q8N9W5 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAAF3Q8N9W5 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAAF3Q8N9W5 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAAF3Q8N9W5 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAAF3Q8N9W5 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAAF3Q8N9W5 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAAF3Q8N9W5 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAAF3Q8N9W5 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAAF3Q8N9W5 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAAF3Q8N9W5 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAAF3Q8N9W5 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAAF3Q8N9W5 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAAF3Q8N9W5 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAAF3Q8N9W5 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAAF3Q8N9W5 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAAF3Q8N9W5 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAAF3Q8N9W5 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAAF3Q8N9W5 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAAF3Q8N9W5 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAAF3Q8N9W5 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAAF3Q8N9W5 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAAF3Q8N9W5 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAAF3Q8N9W5 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAAF3Q8N9W5 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAAF3Q8N9W5 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAAF3Q8N9W5 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAAF3Q8N9W5 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAAF3Q8N9W5 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAAF3Q8N9W5 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAAF3Q8N9W5 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAAF3Q8N9W5 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAAF3Q8N9W5 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAAF3Q8N9W5 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAAF3Q8N9W5 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAAF3Q8N9W5 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAAF3Q8N9W5 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAAF3Q8N9W5 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAAF3Q8N9W5 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAAF3Q8N9W5 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAAF3Q8N9W5 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAAF3Q8N9W5 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAAF3Q8N9W5 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAAF3Q8N9W5 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAAF3Q8N9W5 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAAF3Q8N9W5 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAAF3Q8N9W5 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAAF3Q8N9W5 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAAF3Q8N9W5 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAAF3Q8N9W5 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAAF3Q8N9W5 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAAF3Q8N9W5 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAAF3Q8N9W5 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAAF3Q8N9W5 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAAF3Q8N9W5 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAAF3Q8N9W5 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAAF3Q8N9W5 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAAF3Q8N9W5 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAAF3Q8N9W5 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAAF3Q8N9W5 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAAF3Q8N9W5 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAAF3Q8N9W5 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAAF3Q8N9W5 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAAF3Q8N9W5 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms